自西元20XX年(⛲),人类(🥇)从肯亚(yà )图尔卡纳湖(hú )的(de )湖畔挖出(🛍)了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体(tǐ )之后,便开(🎾)始(📿)对它(👋)进(jìn )行(háng )(🎲)研究,后来有人重建(🖲)出来(lái )(🐿)所谓的(👑)“神之(zhī )语言(yán )”,并(bìng )(👁)建立电脑程式以启(qǐ )动原始索哈尔,进行和上位(✖)领域的U-DO(上(🤯)位领域当中(zhōng )的红色(🌙)波动存在)连(🌚)结的连(🛑)结(⏯)实验,但很不幸地(dì ),从(cóng )上位领域流(liú )入下(xià )位领域(yù )的能量造成了事(shì )象变移(yí ),使地(⏰)球(游戏(🥫)中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎(🎋)完从从宇(🧟)宙中“消失”,人(🗳)类因(🈁)而被迫逃亡,离(🍑)开(kāi )(👊)地(🛎)球。 (🦇)到(😊)了四千年(nián )多后,在故事(shì )(🤷)开(🃏)始前十(shí )五的T.C.4753年,米(🈺)尔奇亚(🔍)行星(Miltia)爆发(fā )了所(🥅)谓的米(mǐ )尔(ěr )奇亚冲突(tū )(🔎)事件,在此次事件当(💣)中,米尔奇亚行星(xīng )的人类疑似遭到了(le )格(🚻)诺西斯(Gnosis)的(de )攻击(jī ),并在冲突事件后消(xiāo )失,但事件的真相却因为米(mǐ )尔奇亚(🚪)的消失而不为人(rén )知。在事(shì )件(jiàn )后(hòu ),启动(🍾)原(yuán )始索哈(📯)尔(后来人类制造(zào )出了(🌒)十(🎁)二具索(🏖)哈(🍝)尔模拟体,因此原有的(🔝)索哈(hā )尔就(jiù )被称之为原始索哈尔)所需(🐼)的神(shén )之(zhī )语言、原(yuán )始索(suǒ )哈尔的研(🦄)究成果、米尔(📳)奇(qí )亚的U.M.N.座(🏓)标等事(shì )物(🃏),都(📛)被封存(🏺)在(🥈)Y资料当中,而(ér )Y资(🤫)料又被封(💽)存在百(🔭)式观(guān )测用合成人(rén )(Relian)M.O.M.O.的(de )意识内(👉),然而这(🈲)么(me )做却引起(🛍)了各方(fāng )势(🚬)力对M.O.M.O.的争夺,因(🚹)此星(xīng )团(tuán )(🐎)联邦政府(游戏(🙎)中统治各(gè )行星的政府,英(🎅)文名Galaxy Federation)雇了(😓)一个名叫Ziggurat 8的生(🏃)化(huà )人(Cyborg),以保护M.O.M.O.的安全。 另一(✝)方面,在(☕)米尔(ěr )(👑)奇亚冲突事件结(jié )束(shù )后的十几年,也就(jiù )是(shì )大约在游戏(🐺)EPI开(👮)始的时候(hòu ),当时(🈶)最(📮)大的(📂)企(🚔)业贝(🔅)克(🛀)达公司(sī )以对抗格诺西斯侵扰的(de )名(míng )义,进(jìn )行对格诺西(xī )斯用(yòng )战(zhàn )斗兵器KOS-MOS的开发计(🔹)划(🔨),但和当时多使用(🍚)合(hé )成(chéng )人(rén )(Relian)与生化人(Cyborg)的(de )(🚁)情况所不同的是,KOS-MOS是个(gè )纯粹的机械(xiè )(🍺)制品。另一方面,在(zài )EPI开始(shǐ )时,参与(🏉)KOS-MOS开发计划的(🧔)贝(👪)克达(dá )(📃)公司第(dì )一(😿)开发局(jú )研究(jiū )(🕙)人员卯月(📘)紫苑,正乘着(📿)当时载(🐕)有还(🈶)没正(🚲)式(shì )(⬇)启动的(🌨)KOS-MOS的Woglinde号(hào )太空船进行旅途(tú )。但没想到(🏹)其太空船却(🏺)被冲著索哈尔而来的格(gé )诺(nuò )西斯所攻击,而KOS-MOS也在此时(shí )突然启动,卯月紫苑因而被(bèi )卷入(rù )一连串和(🔙)格(gé )诺(nuò )西斯及索哈尔有关(⏺)的阴谋(móu ),以及(jí )会改(gǎi )变人类(🐬)命运的事件当(dāng )中……